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保育豬胰脂肪酶、胰蛋白酶、胰淀粉酶等活性下降。小腸出現嚴重的絨毛萎縮，隱窩變深，腸黏膜淋巴細胞增生和隱窩細胞有絲分裂速度加快。抗體水平降低，免疫力和抗病能力低。腸道大腸桿菌、鏈球菌等有害菌大量繁殖，破壞仔豬斷奶前形成穩定的微生態系統，而整個腸道功能的紊亂又會加劇腸道黏膜的損傷，極易引起各種疾病的發生。

因保育階段正是各個器官正在發育的時候，消化系統發育不成熟，分泌的鹽酸和消化酶的能力不足，小腸黏膜抵抗能力弱，易被各種外源性蛋白抗原損傷，保育豬只腸黏膜受損即可導致此階段發病。日糧中抗原引起豬腸道發生細胞介導超敏反應，超敏反應可造成腸道黏膜組織損傷，進一步使小腸絨毛萎縮，隱窩增生，進而引起功能性變化，腸道吸收功能降低，造成豬只消化遲滯，從而導致保育階段豬光吃不長，形成僵豬。

免疫空白期是指免疫接種后機體抗體水平低于有效抗體水平的時間段就是免疫空白期。通常在豬的免疫空白期病原體會乘虛而入，然后通過黏膜的巨噬細胞和抗原遞呈細胞進行復制，再將病原體分布到相關的組織和器官，引起臨床病癥。

藍耳病的免疫空白期長。藍耳病弱毒苗免疫后，中和抗體的產生在四周以后，干擾素的產生更慢。而藍耳的感染，消除病毒血靠中和抗體，消除持續感染靠干擾素。也就是說，疫苗免疫后大約一個月才能有好的保護作用，在這之前為免疫空白期。在免疫空白期內，如果有感染或其它影響免疫力的因素干擾，可能導致免疫失敗。

因藍耳病的免疫空白期較長，在此期間，細菌、病毒、支原體等病原微生物進入呼吸道時會分泌出一種具有黏連附著功能的絲狀蛋白質，能使其附著于呼吸道纖毛頂端，引起纖毛上皮細胞發生病變或死亡、破壞呼吸道黏膜層，使纖毛發生萎縮或脫落，正常功能受損或減弱，并阻止黏膜的自身修復，使機體的黏膜屏障降低，黏膜分泌SlgA(分泌型免疫球蛋白)減少，黏膜免疫失敗，因此，此階段易發生呼吸道疾病。

母豬妊娠后期（85天—產前3天），懷孕后期是胎兒快速生長時期，胎兒后期生長較快，不斷對腹腔施加壓力，此階段母豬腹壓較大，母豬喜臥，運動減少導致母豬腸胃蠕動受阻，母豬發生便秘。母豬便秘對腸道黏膜造成機械性損傷后，腸內有害細菌在糞便中大量繁殖，導致母豬炎癥和抵抗力下降，極易引發呼吸道、消化道、生殖道等一系列疾病。在許多的傳染性疾病中，病原體都是經呼吸道或消化道粘膜而進入體內的，它們是機體的天然門戶，只有保護好病原體侵入的門戶，保證母豬呼吸道、消化道、生殖道黏膜的完整和功能的健全，才能有效避免母豬在此階段發生疾病。同時，可有效避免母豬產后生殖道炎癥的發生。

免疫接種、轉群、天氣突變、長途運輸等原因都可造成豬發生強應激反應。強應激的發生會使機體出現食欲減退，精神障礙等一系列的反應。可引起免疫系統抑制，抗病能力下降；引起上皮細胞受損，黏膜完整性破壞，增加疾病的發生率。

日常養殖過程中冷、熱應激極易破壞呼吸道黏膜，冷空氣刺激呼吸道黏膜，使局部血管收縮，出現循環障礙造成局部營養不足，引起纖毛上皮活動減弱或停止、溶菌酶分泌減少，屏障機能受到破壞，機體抗感染能力隨之降低，使呼吸道粘膜易受病原微生物的侵害發生呼吸道病。高溫時豬呼吸次數增加，導致呼吸道粘膜血管充血，時間一長因血管擴張纖毛易脫落，粘膜損傷，易感染病原微生物。所以，日常養殖中應盡量降低對豬群的各種應激，從而減少強應激引發各種疾病發生的可能性。